카테고리: 동물실험 도구 (in vivo/in vitro 프로토콜·데이터 분석) · Axis: ex vivo 분리·외식편 조직 정적 incubation 기능 assay의 uptake/release·생존도·dose-response 정량 — 직전 18개 동물 항목(challenge AUC·whole-slide morphometry·indirect calorimetry·telemetry·DXA·세포 Seahorse·췌도 perifusion·in vivo flux) axis와 분리된 신규 axis(ex vivo isolated-tissue static-incubation functional assay) · 도메인 커버리지: DM(분리 골격근 2-DG uptake) + Obesity(지방 외식편 lipolysis) + MASLD(간 PCLS 생존·기능·dose-response) · 방법: scintillation/plate reader/colorimetric/qPCR raw → numpy/scipy 4PL EC50/IC50·spillover·표준곡선·mixed-effects 자체구현 · 모두 standalone Streamlit 오프라인 동물실험 분석 도구
⚠️ 본 도구 3종은 모두 연구·교육용(참고용·연구용) prototype ex vivo assay 데이터 분석 도구입니다. 모든 scintillation dpm·plate reader·dose-response·생존도 값은 합성(synthetic)·예시(illustrative) 값으로 실제 실험 readout이 아닙니다. 산출되는 흡수율·release rate·EC50/IC50·치료지수·생존도·cohort 통계는 방법론 시연용이며, 신약 전임상 의사결정·논문 보고·동물실험 결론의 단독 근거로 사용 불가. 실제 분석은 검증된 raw 데이터와 정식 통계 검토가 필요합니다.
1️⃣ ExVivoMyoUptake DM · 분리 골격근 ex vivo 2-DG glucose uptake
엑스비보마이오업테이크 — 분리 골격근(soleus/EDL/FDB) ex vivo incubation [3H/14C]2-DG glucose uptake scintillation raw를 받아 dual-label spillover·[14C]mannitol extracellular space·specific activity·tissue weight를 보정한 흡수율을 산출하고 insulin dose-response EC50·수축 자극 효과·cohort 통계까지 처리하는 standalone Streamlit 동물실험 분석 도구
ex vivo isolated muscle 2-DG uptake assay는 근육 자체의 세포-자율적(cell-autonomous) 인슐린 민감도와 수축(전기자극)에 의한 인슐린-비의존 포도당 흡수(GLUT4 translocation)를 전신 순환·혈류·호르몬 교란 없이 분리 측정하는 표준 assay. GLP-1RA/tirzepatide 근육 직접효과(논쟁적)·SGLT2i·imeglimin·AMPK 활성화제·운동 모방제·조직특이적 KO mouse 검증에 필수. 재현성 문제는 (a) dual-label spillover(3H↔14C crossover) lab마다 비표준 (b) mannitol extracellular space 보정 생략 (c) specific activity 계산 오류 (d) viability QC 누락 (e) EC50 따로 적합. (1) scintillation raw + spillover 행렬 보정 (2) extracellular space 차감 + specific activity + tissue weight normalize → 흡수율(pmol/mg/min) (3) basal vs insulin(농도구간) vs 수축 비교 + 4PL EC50·fold·insulin 민감도 지수 (4) 모델 reference(C57BL/6·db/db·ob/ob·DIO·HFD·노화) + viability QC (5) group×muscle×condition two-way ANOVA/mixed-effects + mechanism 분류 + 국·영문 docx. OpenClaw 바이오 피벗 약물 재조합 후보의 근육 직접 효능 ex vivo 검증 layer·닥터앤서 3.0 당뇨 약물 전임상 검증 layer로 alignment.
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2️⃣ AdipoLipoKinetics Obesity · 지방 외식편 ex vivo lipolysis kinetic
아디포라이포카이네틱스 — 지방 외식편·분리 지방세포 ex vivo lipolysis assay의 glycerol·NEFA plate reader raw·표준곡선·시간곡선을 받아 release rate·re-esterification 보정·β-agonist EC50·insulin 항지방분해 IC50·normalize·cohort 통계를 표준 산출하는 standalone Streamlit 동물실험 분석 도구
ex vivo lipolysis assay는 지방조직 자체의 β-아드레날린 자극 지방분해와 인슐린의 항지방분해(antilipolytic) 작용을 전신 교란 없이 분리 측정하는 표준 assay. 차세대 항비만약(GLP-1RA·tirzepatide·retatrutide·CagriSema)·β3-agonist(mirabegron)·갈색지방 활성화제·지방 조직특이적 KO mouse의 지방 직접효과 검증에 필수. 재현성 문제는 (a) glycerol vs NEFA 불일치(re-esterification·재활용으로 NEFA 과소평가 — 보정 비표준) (b) 시간곡선 선형구간 선정 임의 (c) 표준곡선·blank 비표준 (d) normalize 기준(weight/DNA/단백질/세포수) 혼용 lab간 비교 불가 (e) EC50/IC50 따로 적합. (1) plate reader raw + 표준곡선(선형/4PL) R² QC·blank (2) 선형구간 자동탐지 release rate + glycerol vs NEFA로 re-esterification 분율 + normalize 옵션 (3) isoproterenol/CL316243/forskolin dose-response 4PL EC50 + insulin 항지방분해 IC50·최대억제율 (4) depot(eWAT·iWAT·scWAT·BAT)·모델 reference + QC flag (5) group×depot×stimulus two-way ANOVA/mixed-effects + mechanism 분류 + 국·영문 docx. OpenClaw 바이오 피벗 비만 약물 재조합 후보의 지방조직 직접 효능 layer로 alignment.
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3️⃣ HepatoSliceAssay MASLD · PCLS ex vivo 배양 생존·기능·dose-response
헤파토슬라이스어세이 — 정밀절단 간조직편(PCLS) ex vivo 배양의 생존도(LDH/ATP/WST/resazurin)·기능(albumin/urea/TG)·섬유화(αSMA/COL1A1) 시간경과·dose-response raw를 받아 생존도 decay 보정·효능 EC50·독성 IC50·치료지수·동물/slice 변이 분해·cohort 통계를 표준 산출하는 standalone Streamlit 동물실험 분석 도구
PCLS는 간의 모든 세포종(간세포·HSC·Kupffer·내피·담관)과 3D 조직 구조를 보존한 채 ex vivo 배양하는 모델로, 단세포 배양이 못 잡는 다세포 crosstalk·섬유화 반응·약물 반응을 살아있는 동물 없이 평가 — 동물 사용 감소(3R: Reduction)에 부합. MASLD 약물 후보(resmetirom·VK2809·FGF21 analog·ACC 억제제·FXR agonist·GLP-1RA/GIP/GCG·항섬유화제)의 ex vivo 효능·독성 window 스크리닝에 활용. 재현성 문제는 (a) 생존도 decay 보정(자연 감소를 약물 독성과 분리 — vehicle·time-matched 비표준) (b) slice 두께·무게 정규화 비표준 (c) 다중 readout 따로 분석·통합 부재 (d) 치료지수(IC50/EC50) 산출 누락 (e) 동물 간 vs slice 간 변이 혼동. (1) 다중 readout ingest + slice normalize (2) 생존도 decay 보정 + 배양 가능 window (3) 효능 EC50 + 독성 IC50/CC50 + 치료지수·therapeutic window (4) inter/intra-animal nested/mixed-effects 변이분해 + 모델 reference(GAN·CDAHFD·MCD·AMLN·HFD·db/db·ob/ob) (5) group×농도×시점 mixed-effects + 분류(항섬유화/항지방증/독성한계형) + 3R 절감 기록 + 국·영문 docx. OpenClaw hepatic 약물 재조합 후보의 ex vivo 효능·독성 스크리닝 layer로 alignment.