카테고리: 동물실험 도구 (ex vivo whole-slide IHC/IF wet-lab → dry-lab 자동 정량 standalone Streamlit) · 도메인 커버리지: DM + Obesity + MASLD · 모두 합성 WSI + heuristic-based segmentation 시연
⚠️ 본 도구는 모두 연구·참고용입니다. 임상 진단·의사결정에 사용 금지. 모든 데이터는 합성(synthetic) WSI(2D numpy array) + heuristic-based segmentation 시연이며, 실제 NDPI/SVS/CZI WSI export·Cellpose·StarDist·segmentation_models 무거운 ML 호출 없음. 실제 lab 적용 시 IRB/IACUC 승인 + 사이트별 fine-tune + lab-specific marker validation 필수.
1️⃣ PancIsletMass DM · β-cell mass morphometry
팽크아일릿매스 — 췌장 multiplex IHC WSI → 자동 β-cell mass morphometry pipeline standalone Streamlit 도구
마우스 췌장 multi-channel IHC/IF WSI 입력 → (1) NDPI/SVS/CZI/OME-TIFF 다채널 정렬 (insulin/glucagon/somatostatin/Ki67/TUNEL/DAPI) (2) 췌도 auto-detection (Cellpose 2 + custom islet segmenter) + area/perimeter/circularity (3) α (glucagon+) / β (insulin+) / δ (somatostatin+) 분류 + Ki67+∩insulin+ replication / TUNEL+∩insulin+ apoptosis co-localization (4) Cavalieri systematic random sampling → β-cell mass(mg) 자동 계산 (5) Serial-section 3D islet 재구성 + control/HFD/drug 그룹 ANOVA + violin/scatter export. 글로벌 islet/diabetes lab ~250개 대상, 마우스당 8-12h → 30-60min 단축. 핀포인트(IsletPerifusionAnalyzer=in vitro perifusion functional GSIS)와 dimension 자체 다름(structural mass morphometry).